Az, hogy a klónok akiket felhív Sidious tudják miről is beszél, az azt jelentené, hogy be vannak avatva kitudja mi óta. Ez potenciális veszély lenne, hogy kitudódik a terv idő előtt. Plusz még ha a vezető klónok engedelmeskednek is a nagyúrnak, az nem garantálja, hogy azok a klónok akik addig nem voltak beavatva, simán a felettesük parancsára halomra lövik a Jediket. (A feltétlen parancsteljesítés szerintem a legrosszabb magyarázat. Arra ott vannak a droidok.)
Szerintem a chip jó megoldás. Senki nem tud semmit, amíg nem kell tudnia. Sidious felhívja a parancsnokokat és a megfelelő időben bemondott "Hajtsa végre a 66-os parancsot" szöveggel aktiválódik a chip és egy memória szekvencia az agyukban, egyből tudják, hogy miről is hadovál az öreg, mit kell tenniük, nem gondolkodnak. A parancsnokok tovább mondják rádión minden klónnak és mindenki "aktiválva" van.
Lehet, hogy a következő részek után többet tudunk majd, de szerintem ez a legtisztább magyarázat amit kitalálhattak.